«Лазерная медицина» регулярно издается с 1997 года.
Первым учредителем журнала была фирма «Техника». С 1998 г. в состав учредителей вошел Государственный научный центр лазерной медицины Минздрава РФ; в 2004 г. — Российский университет дружбы народов. С 2005 г. единственным учредителем журнала является Федеральное государственное бюджетное учреждение «Государственный научный центр лазерной медицины им. О.К. Скобелкина Федерального медико-биологического агентства».
Итоги десятилетней работы (1997-2006) обобщены в юбилейном номере журнала (см. т.10, выпуск 4, 2006 г.), где помещен структурированный «Библиографический указатель работ», опубликованных в журнале «Лазерная медицина» в 1997-2006 годах, который включает сведения о 505 научных статьях из 32 выпусков 10 томов журнала. Итоги работы журнала представлены в «Сводном тематическом указателе публикаций в журнале «Лазерная медицина» в 2007-2011гг. (том 15, вып. 4, 2011) и «Сводном тематическом указателе публикаций в журнале «Лазерная медицина» в 2012-2016 гг. (то 20, вып. 4, 2016).
Журнал включен в базы данных ВИНИТИ РАН, «Российский индекс научного цитирования» на платформе Научной электронной библиотеки Журнал входит в Перечень ВАК РФ ведущих рецензируемых журналов и изданий, в которых должны быть опубликованы основные результаты диссертаций на соискание ученой степени доктора и кандидата наук.